先从概念上来区分：
WMS仓库管理系统：
WMS是仓库管理系统(Warehouse Management System) 的缩写，是对物料存放空间进行管理的软件，区别于库存管理。其功能主要有两方面，一为通过在系统中设定一定的仓库仓位结构对物料具体空间位置的定位，二为通过在系统中设定一些策略对物料入库\出库\库内等作业流程进行指导。
仓库管理系统是通过入库业务、出库业务、仓库调拨、库存调拨和虚仓管理等功能，对批次管理、物料对应、库存盘点、质检管理、虚仓管理和即时库存管理等功能综合运用的管理系统，有效控制并跟踪仓库业务的物流和成本管理全过程，实现或完善的企业仓储信息管理。该系统可以独立执行库存操作，也可与其他系统的单据和凭证等结合使用，可为企业提供更为完整企业物流管理流程和财务管理信息。
许多企业已认识到企业管理信息对企业发展的战略意义，从财务软件、进销存软件CIMS,从MRP、MRPII到ERP，代表了中国企业从粗放型管理走向集约管理的要求，竞争的激烈和对成本的要求使得管理对象表现为：整合上游、企业本身、下游一体化供应链的信息和资源。 而仓库，尤其是制造业中的仓库，作为链上的节点，不同链节上的库存观不同，在物流供应链的管理中，不再把库存作为维持生产和销售的措施，而将其作为一种供应链的平衡机制，其作用主要是协调整个供应链。但现代企业同时又面临着许多不确定因素，无论他们来自分供方还是来自生产或客户，对企业来说处理好库存管理与不确定性关系的唯一办法是加强企业之间信息的交流和共享，增加库存决策信息的透明性、可靠性和实时性。而这，正是WMS所要帮助企业解决的问题。
TMS运输管理系统：
TMS是TransportationManagementSystem的英文缩写，意为运输管理系统。在管理软件中，以英文缩写命名的系统名称并不鲜见，TMS大部分只作为一个管理系统中的其中一个子系统来运用，主要在物流管理系统中，其主要功能是对物流环节中的运输环节的具体管理，包括车辆管理，在运途中货物的管理等。
物流运输管理系统适用于运输公司、各企业下面的运输队等，它主要包括订单管理、配载作业、调度分配、行车管理、GPS车辆定位系统、车辆管理、人员管理、数据报表、基本信息维护、系统管理等模块。该系统对车辆、驾驶员、线路等进行全面详细的统计考核，能大大提高运作效率，降低运输成本，使您在激烈的市场竞争中处于领先优势。
TMS可以在大型物流门户综合网站中当作SaaS软件服务的一种，主要功能包括：业务流程管理(BPM)、托运单管理、订单跟踪、货物跟踪、从业人员管理、运输业户管理，实现运输业务流程的可视化监控、结算管理等。
TMS能够对物流公司的所有车辆进行实时跟踪(结合GPS系统)，保持信息流和物流的畅通。
我们常说的生鲜配送管理系统广义而言也是SaaS的一种，在普通的仓储中的商品大多数都是普通3C、服装、家纺、化妆品等产品几乎全是标准品，即使号称是食品仓，但里面的产品也一般是加工完成的耐存储的商品，例如三只松鼠等。而生鲜类产品就是非标准品。因此生鲜行业的公司若使用的一般的进销存系统，根本无法做到精细化管理，况且这类系统也完全没有生鲜配送行业需求的突出功能。虽然减轻了一定的劳动强度，但用起来并不那么顺手，远远达不到观麦系统类似对信息化管理的期望。可能外行人并不懂生鲜的难易性，生鲜与其他品类相比，有很大的不同，并非一般的进销存系统可以满足。
如何选择TMS，才能真正实现其价值?
1. 功能与业务的匹配性
在货运市场上，普遍存在货主、三方、专线直到司机、乃至收货人这样的纵向链条，在这个链条上每个参与者都有从不同层面使用TMS不同功能的诉求，但是每一方的诉求又不尽相同，目前市场上有许多专为其中某一环节使用的TMS。
所以，首先重要的是了解自己的运输业务，然后基于业务管理的需求确定目标TMS应该具备的基本功能模块，来框定TMS的基本选择范围。
2. 解决方案的完善性
在通过功能匹配框定了一定领域的TMS供应商之后，接下来需要考虑的就是功能的解决方案的完善性。通常来说，对与货主企业来说，运输管理的核心流程基本涵盖了：物流招采、合同执行、运单管理、调度、执行、追踪、结算、审计、数据分析这些核心领域。
选择TMS，务必要让供应商能把方案做到细节，如果一家供应商能够基于调研的真实业务场景做方案，说明第一这家供应商对自己系统的完善性有自信;第二愿意对客户负责;第三方案能够落地。
目前来看，在鞋服物流领域，oTMS应该是功能完善性最好的、也是耕耘时间最久、业内客户数最多的。
3. 技术和性能
技术可以主要看操作易用性、部署难度和复杂性、数据安全性。基本来说，如果一个TMS同时支持APP、网页端、API，那么我们认为他的操作易用性是较高的。
4.用户界面的友好性
一个好的界面可以让用户专心的处理好自己的工作，而无需频繁的打开多个软件或窗口。直观而简洁的设计，使系统很学习成本变得更低，员工更容易上手使用。
5.客户支持能力
这点包括了实施服务，培训和维护，也就是我们常说的“售后”，国内外一些比较现金的SaaS供应商也有叫“客户成功“的做法。其实很容易理解，TMS和一般的财务软件、仓储软件不同，后者的用户数量往往很少且固定，加之办公场所也固定，通过on site的培训、要求、监督，其实是很难“失败“的。但运输业务，是企业中唯一发生场所不固定(可能发生在全国每个地方、甚至海外)、参与人员不固定(往往层层转包)，所以非常难于管理、但又非常重要的(因为直接面对客户、直接影响客户体验，也因为运输支出往往不小)。
6. 市场的领导力
市场领导力包含了市场的占有率和产品的前瞻性。选择一家有市场占有率的产品，意味着很大可能性下游、下下游的一些承运商、司机已经在使用这个产品、或者未来其他业务上很可能也会用到该产品，那么就大大降低了推广难度又提升了使用效果。目前，oTMS应该不仅在鞋服领域TMS市场占有率遥遥领先，在制造业、医药、汽车、化工、消费品等综合领域，市场份额也是稳居前茅的。从这个角度，笔者认为是有加分项的。
WMS和TMS的三种主要集成方式：
通常都同过OMS或者企业ERP集成，OMS/ERP->WMS->TMS的交互顺序，但是在订单处理、运输计划上差别较大，适合不同的应用行业。
1.基本集成
WMS拣货完成至暂存区后，发送订单至TMS，优点：简单高效准确，缺点:浪费分拣和STAGE的时间、对STAGE场地的占用。
2.计划集成：预先计算出货量发送TMS，WMS和TMS同步执行。
由于预先计算出发货的数量、重量、体积，可计划货运能力，在分配库存和拣货同时进行运输计划，确认运力，当货物分拣好后可以直接装车发运，解决了基本集成方式中的缺点。但是，当计划的货量与实际发运货量相差较大时，该方式的缺点就很明显了。
3.面向客户集成，在分配库存后即可确定发运和交付。通常在占住库存后，即可在交互页面上，与客户确定货运的appointment，然后确认运输计划，大大增强客户体验，对系统的响应能力、集成性要求也是最高。
关键词： 仓库管理系统 运输管理系统 系统的区别 仓管与运输系统如何选择
